胜生勇利（丰永利行 配音）是一名花样滑冰选手，在挑战赛中失利的他赶回了故乡九州，不知道自己一片迷惘的前途该何去何从。就在此时，一位名叫维克托（诹访部顺一 配音）的花滑教练出现在了勇利的面前，他曾是世界选手赛中连续五届称霸的王者，亦是勇利从小就憧憬的对象。 维克托的出现改写了勇利的未来，与此同时，样貌与品行严重不符的俄罗斯少年尤里（内山昂辉 配音）亦出现在了勇利的身边。在维克托的帮助下，勇利重新找回了对花滑的信心和热爱。乐观温柔的埃米尔（日野聪 配音）、沉默寡言却实力强大的奥塔别克（细谷佳正 配音）、内向羞涩的季光虹（本城雄太郎 配音），这些个性迥异的选手们和勇利一起活跃在赛场之中！
柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。 柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
五河士道（岛崎信长 配音）是一位平凡的高中生，一次偶然之中，他邂逅了名为十香（井上麻里奈 配音）的精灵。精灵是来自于异世界的物种，虽然有着足以迷惑人类的可爱外表，却亦拥有着能够毁灭世界的可怕能力。 然而，精灵有着一个十分巨大的弱点，那就是害怕被他人讨厌，因此只要同她们约会，就能轻易的击败这群强大的种族。而士道则恰恰拥有这一关系到人类命运的能力，于是，士道置自己的性命于危险之中，开始了和十香等精灵们的约会。与此同时，一群想要将精灵除之而后快的危险分子亦在暗中接近着士道，而精灵们的存在，使得一个关乎到世界存亡与否的秘密渐渐浮出水面。
