高中生八坂真寻,在某天晚上突然被怪物袭击,此时出现搭救他的,就是自称克鲁苏神话中外神之一的银发美少女奈亚拉托提普(昵称奈亚子)。 身为宇宙人的她是神话中可以自由变化外表的"无貌之神",由于其它的宇宙人正准备攻击真寻,所以才会被派遣到地球来保护他,之后便展开了同居生活。
性格内向的小学四年级男生阳向，默默喜欢着班上的人气女孩时雨。两人拥有着共同的爱好——喂养学校的小鸟。在一次偶然中，阳向和时雨开始有了接触，两人渐渐拉近了彼此间的距离。对未来发展充满希望的阳向在心中描绘着与时雨共处的美妙情景，然而天有不测风云，不久后对方要转校的消息传来，悲伤的阳向变得无精打采，却迟迟无法开口倾诉自己的感情。到了时雨即将离开的这一天，阳向终于打破了心中鸟笼的桎梏，下定决心奔跑起来。“我想说的是——我喜欢你，时雨同学！”阳光中的青时雨，与心中幻想的那只天鹅一同飞翔的阳向，能否将自己的心意传达给时雨呢？
在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别驾驶着零号机、初号机和2号机，抵抗了第八使徒猛烈的攻击，在这一过程中，淡淡的情愫悄然在这三个青年男女的心中萌生。不久后，第九、十使徒相继降临，真嗣他们面临着生与死的残酷考验……rn本片为福音战士新剧场版四部曲第二部。
现实中一切极端的梦境，都凝聚着可怕的能量。唯有将这些梦境送入异次元世界——梦界化消，才能避免这些能量对现实世界造成扭曲动荡。个性跳脱的任小冲，因巧合被来自梦界的渡梦使选中，成为笛见塔的化梦武士，展开了奇异的化梦之旅。在他与同伴武伽矛盾加剧的同时，另一座墨决塔悄悄展开了对笛见塔的侵略阴谋，并牵扯出梦界沉睡已久的秘密传说……
在乐阳和小灵兽还有朋友们相识多年后的未来，因不满科技发展导致的严重污染，有人利用高科技小灵兽搞破坏。真诚正直的小璘为了保护小灵兽们来到乐阳的时空，但掠夺者也一起来了。了解到小璘对未来世界美好环境的向往，乐阳怀着对伙伴的关切之心，联手小璘还有朋友们一起守护小灵兽，阻止掠夺者破坏环境。乐阳和朋友们凭着热诚的心，与小灵兽为伴，一起终结环境危机。
