位于南洋腹地的一个无名小岛，隐藏着一个科技发达的实验室。实验室中，一个未知的生命正在孕育。此前不久，疯狂的科学家们在某个远古遗迹提取到了最强宝可梦梦幻的基因，随后利用现代科技，提供基因提升改造，人工创造了无可匹敌的宝可梦——超梦。超梦诞生之初，对自己的命运倍感困惑，旋即暴走。但是一个心怀叵测的男人出现，用花言巧语哄骗了超梦，使其和自己联手操控世界。然而无论打败多少对手，超梦仍然充满困惑，不知自己是谁，为何拼命战斗，又为何降生于世。 当他的困扰达到顶点之际，超梦再度暴走，回到了当初诞生的小岛，心中充满了无限的憎恨……
故事发生在星风高中内，和泉隼斗（兴津和幸 配音）信心满满地参加了第一届学生会长的选举，他觉得凭借自己高超的实力，一举夺得学生会长的宝座简直不在话下。就在这个节骨眼上，一位名叫若菜羽衣（竹达彩奈 配音）的女生站在了他的对手席上，而羽衣主持的主张，竟然是荒唐的校园内恋爱自由化，紧接着，羽衣拿出了一大堆安全套，抛向了台下欢呼叫好的同学们。结果可想而知，羽衣当选了。 就这样，隼斗被迫成为了副会长，辅佐羽衣，然而，令隼斗没有想到的是，羽衣竟然跑到了自己的家里，还宣称自己是他的未婚妻。原来，两人的父母在很早之前就认识了，关系十分要好，两家的孩子就此结下娃娃亲。面对突如其来的学生会长未婚妻，隼斗会怎样应对呢？
